Kogami, Rintarô et Kaede sont de retour dans le présent… bien malgré eux ! À peine arrivés, les voilà déjà pris pour cibles par de terribles créatures. Alors que tout semble perdu, les secours arrivent enfin mais… n'est-il pas déjà trop tard ? Pendant ce temps, à l'hôpital, les choses dérapent, tandis que les différentes pièces de l'échiquier semblent se placer pour réaliser les desseins de la créatrice des Magical Girls de l'Apocalypse. Et l'apparition d'une Magical Girl à froufrous et rubans continue d'empirer la situation. Reste-t-il seulement une lueur d'espoir pour nos héros ?